El Centro tiene como misión contribuir a la conservación, restauración, manejo y producción sostenible de paisajes, por medio de la generación de conocimiento científico y técnico sobre ecología forestal, propagación y producción de especies nativas, y las interacciones existentes entre suelo-bosque y cultivos-árboles. Para esto cuenta con lo siguientes grupos de investigación:
- Suelos Forestales
- Agroforestería y Socioeconomía
- Restauración y Manejo Forestal